对于当前高标准农田建设管理中仍存在一些困难和问题，吴德建议从以下三方面着手：
进一步增加高标准农田建设资金投入，着力解决项目资金与建设任务不匹配的问题。要建成“旱涝保收、宜机作业”的高标准农田，建议提请财政部增加高标准农田建设的中央财政预算，鼓励发行专项债券，引导更多资金投入到高标准农田建设中；进一步理顺高标准农田建设管理体制，着力解决职能人员划转落实存在“中阻梗”的问题。
建议提请中央编办牵头，全面落实农田建设管理机构的职能划转、人员配置以及资金渠道；加快推动高标准农田建设立法。建议提请全国人大加快推动《农田建设条例》的颁布，进一步明确地方政府在农田建设和管理上的主体责任、支出责任，规范建设标准，强化过程管理和建后管护，明确高标准农田的征收条款，防止占优补劣。
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