徵菌性疾病
【发病症状】金鱼是变温动物，体温是随着水温而改变，当冬季水温降低，鱼体抵抗力亦随之减弱，因此受徵菌感染的情形很普遍。患病的金鱼身体会长出白色棉花状物体，尤其是头上的肉瘤最易受感染。
【防治方法】应尽量保持缸水清洁，用甲烯蓝染液涂抹患处可加快痊愈，也可施孔雀绿溶液治疗法，把病鱼浸泡于一百公升水含0.2公克的药物溶液中，直至其痊愈为止，亦可直接用Sera治徵菌治生虫剂、女王鲸治徵菌剂、AZ00治徵菌剂治疗。
白点病
【发病症状】白点病是由原生动物所引起，病原体名为白点虫，它会深入皮肤的细胞，进行无性繁殖，形成白色的小点状胞囊。患有此病的金鱼全身满布白点，每个白点胞囊内含有许多幼小白点虫，白点虫吸取鱼体组织的营养而长大并增加数目，后来破囊而出，游到水中，再返回鱼体上侵袭皮肤，形成更多的小白点。
【药物治疗】在患病初期，病鱼会用身体摩擦硬物，希望借此清除身上讨厌的病原体，若不立刻治疗，病鱼身体会迅速受严重破坏而死亡。当白点虫侵入鱼体后，药物治疗不能奏效，只有当小白点虫在鱼体繁殖后，新个体游到水中，药剂才能杀死它们。治疗法为使用百分之0.01浓度的孔雀绿溶液，把病鱼浸泡多天，直至小白点完全消失，孔雀绿溶液的毒性很强，不可使用过量，否则金鱼亦会被毒死，或使用市售的Sera治白点剂、美利坚立灭白点、女王鲸治白点剂、AZ00治外寄生虫剂治疗。
【物理治疗】使用药物治疗金鱼白点病新手不易掌握，且治疗效果不佳，推荐物理治理方法一则，使用加温器将水温非常缓慢的逐步加热到28摄氏度，并保持3天，之后逐步回复正常水温并调换新水，一周内白点原虫全部脱离。该方法简单易操作，副作用小，治理效果非常好。
鱼虱病
【发生原因】鱼虱是一种寄生性的甲壳类动物，大部分时间寄生在金鱼身体上，只有幼虫和成虫产卵期才到水中流动。鱼虱腹面处有两个吸盘，用来吸附在金鱼身体上。口部呈针状，用来刺进鱼体，吸取血液，使患处出血变红，因而易受细菌感染。除非金鱼受大量的鱼虱侵袭，否则不易因此病而死亡。
【防治方法】有机磷的杀虫齐是鱼虱的特效药，但对金鱼也有害处，最好的方法是用尖钳子把鱼虱逐一除去，或用Sera鱼池治生虫剂、美利坚治生虫剂、美利坚去吸虫特效锭、女王鲸治寄生虫剂、AZ00治外寄生虫剂治疗。
吸虫性疾病
【发生原因】侵袭金鱼皮肤、锶和其它器官的吸虫有很多种，较普通的有皮肤性吸虫和锶吸虫两种。
【发病症状】当金鱼受上述吸虫侵袭，身体会痉挛，食欲降低，游动呆滞。鳃部若受严重感染，金鱼会因不能吸取氧气而窒息。
【防治方法】成鱼和幼鱼的治疗法有异，成鱼可放进稀福马林溶液三十分钟，幼鱼以浓食盐溶液代替福马林溶液，寄生吸虫即会被杀死或受刺激而脱离鱼体，或以市售Sera治徵菌性治生虫剂、美利坚治生虫剂及去吸虫特效锭、女王鲸治寄生虫剂、AZ00治外寄生虫剂治疗。
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