灌水排水
藿香既怕干又怕涝，在种植或插后生根前每天早晚各浇水一次，淋水量不宜过多，以浇湿畦面为度。在生长过程中，若遇干旱，畦面发白，便要引水灌溉，每5～8天一次，将水引入畦沟，深达畦高的1/2～2/3为度，让水分慢慢渗透湿润畦面为止。雨季或遇大雨，要注意排水，严防积水，以免根系腐烂，导致植株死亡。因此，在水稻田种植藿香要筑高畦深沟，就是防止雨水过多而积聚，影响藿香的正常生长。
防寒过冬
需要过冬的藿香，特别是在夏秋季节定植的幼小植株，抗寒力差，故有霜冻地区，到了冬初应盖草或搭棚防霜，或者挡北风面，加盖塑料薄膜，保暖防冻害。最好在秋末施入猪牛栏粪肥、加入火土灰、火烧泥壅蔸保暖。于9月栽种的藿香，亦可在10月上旬间种油菜或其他高秆阔叶冬种作物来遮霜防寒冻。
采收加工
藿香于4～6月份采摘嫩茎叶或幼苗。现蕾开花时，采花序洗净，切段。或7～8月份盛花期收获，选晴天齐地面割下，运回迅速晒干、炕干或阴干备用，每公顷产4500～7500千克。藿香以茎枝色绿、干燥、叶多、香气浓郁者为佳。
病害防治
1、根腐病
【危害】多发生于夏季多雨季节，病株从根部和根状茎处发生腐烂，逐渐延至地上部，使皮层变褐色，最后枯萎而死。
【防治】拔除病株并集中烧毁，再在病穴上撒入石灰消毒，或50%甲基托布津800倍液，或用50%多菌灵500倍液浇灌病穴。
2、枯萎病
【危害】在6月中旬至7月上旬发生，最初病株叶片及叶梢部下垂，青枯状，最后根部腐烂，全株枯死。
【防治】发病初期拔除病株并用50%多菌灵500倍液，或50%甲基托布津800倍液，或40%多菌灵胶悬液500倍液浇灌病穴及邻近植株根部。
3、角斑病
【危害】危害叶片，多雨季节发生，开始时呈水浸状病斑，以后逐渐扩大为多角形褐色病斑，严重时叶片干枯脱落，造成减产。
【防治】发病初期用1：1.5：120倍波尔多液，或72%农用链霉素1000倍液、或77%可杀得500倍液喷雾防治，7～10天喷1次，连喷2～3次。
4、褐斑病
【危害】真菌病害，主要危害叶片，5～6月份在叶面形成近圆形的病斑，中间淡褐色，边缘暗褐色，并生淡黑色霉状物，潮湿雨季严重。
【防治】摘除病叶烧毁，用1：1：120倍波尔多液，或64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、或58%甲霜灵锰锌500倍液喷雾防治。
5、斑枯病
【危害】叶片两面病斑呈多角形，初时直径1～3米米，暗褐色，叶色变黄，严重时病斑汇合，叶片枯死。
【防治】发病初期喷洒50%瑞毒霉1000倍液，每隔7天喷1次，连续喷2～3次。
6、蚜虫
【危害】成虫和若虫群集在嫩梢嫩叶上危害，使植株生长不良，不能正常长出新芽新叶。
【防治】用10%吡虫啉可湿性粉剂1000倍液喷洒，或50%抗蚜威可湿性粉剂2000倍液、或40%乐果乳油1500倍液喷洒。收前半个月停药，免留残毒。
7、红蜘蛛
【危害】6～8月高温低湿季节发生严重，吮吸植株营养，橘红色或黄色，在叶背面吸食汁液，受害部位初现黄白色小斑，逐渐成大黄褐色焦斑，最后全叶变黄脱落。
【防治】用虫螨立克1500倍液、或40%速克朗或1.8%阿维菌素3000倍液喷洒。
8、银纹叶蛾
【危害】银纹叶蛾以其幼虫咬食叶片成孔洞或缺刻，幼虫白天潜伏在叶背，晚上和阴天多在叶面取食。
【防治】用90%晶体敌百虫1000倍液，或25%杀虫脒水剂300～350倍液喷雾。
9、卷叶螟
【危害】卷叶螟以其幼虫在幼芽、幼叶上吐丝卷叶，藏于其中咀食叶片。
【防治】用敌百虫300～400倍液叶面喷洒。
10、地老虎、蝼蛄
【危害】害虫咬断幼苗根茎，造成缺苗，影响产量。
【防治】用90%晶体敌百虫做成毒饵诱杀，或用50%辛硫磷1000倍液拌毒土条施于沟内。
部分专业知识转自网络
