在种植水稻时，育苗期以及栽种后，如果遇到低温寒流天气来袭、连绵阴雨天气、秧田水太深、用了未腐熟透的农家肥等，都会引起水稻烂秧。
1、生理性烂芽常见有：淤籽播种过深，芽鞘不能伸长而腐烂；露籽种子露于土表，根不能插入土中而萎蔫干枯；跷脚种根不入土而上跷干枯；倒芽只长芽不长根而浮于水面；钓鱼钩根、芽生长不良，黄褐卷曲呈现鱼钩状；黑根根芽受到毒害，呈“鸡爪状”种根和次生根发黑腐烂。
2、传染性烂芽又分：绵腐型烂芽：低温高湿条件下易发病，发病初在根、芽基部的颖壳破口外产生白色胶状物，渐长出绵毛状菌丝体，后变为土褐或绿褐色，幼芽黄褐枯死，俗称“水杨梅”。立枯型烂芽开始零星发生，后成簇、成片死亡，初在根芽基部有水浸状淡褐斑，随后长出绵鼍状白色菌丝，也有的长出白色或淡粉色霉状物，幼芽基部缢缩，易拔断，幼根变褐腐烂。
3、死苗指第一叶展开后的幼苗死亡，多发生于2～3叶期。分青枯型和黄枯型两种。
（1）青枯型叶尖不吐水，心叶萎蔫呈筒状，下叶随后萎蔫筒卷，幼苗污绿色，枯死，俗称“卷心死”，病根色暗，根毛稀少。
（2）黄枯型死苗从下部叶开始，叶尖向叶基逐渐变黄，再由下向上部叶片扩展，最后茎基部软化变褐，幼苗黄褐色枯死，俗称“剥皮死”。
1.苗床选择：培育秧苗应选在背风向阳、肥力中等、土壤疏松透气、排灌方便、地势稍高的平整田块，做畦要干耕、干做、水耥。
2.避免使用生肥：在育苗床上或者水稻田里施入农家肥做底肥，底肥一定要发酵透，改善土壤质地，有利于秧苗生长。
3.采用新技术进行育苗：为了降低水稻幼苗出现烂秧的几率，用传统的育苗方法已经不行了，要因地制宜采用先进的育苗技术，比如用育苗盘进行育苗、温室育苗等，防止低温出现烂秧现象。
4、精细选种：培养水稻苗，选择种子是关键，种子的好坏直接影响着幼苗的质量，因此在选择种子时一定要精挑细选，选择成熟度好、纯度高、杂质少、饱满无病虫，抗病能力强的种子进行育苗。
5.对种子进行处理：为了提高种子发芽率，在育苗之前要浸泡种子，浸泡的时候要把握好，不能时间太短，也不能泡的时间太长，谷粒呈现半透明状、胚芽膨大、隐约可见腹白为好。然后把水稻种子放在36～38度的环境中进行催芽处理。
6.适时播种：育苗时要根据育苗方式、品种特性、天气情况确定播种日期。避免播种过早低温天气造成烂秧。
7.加强苗期田间管理：在培育水稻苗时，天气晴朗的时候掀开薄膜通风透光，促进种子发芽。多雨天气以及寒流来临之前要及时盖膜，防止幼苗受冻；浇水要小水勤浇，施肥要薄肥勤施，促进水稻苗生长健壮，提高植株的抗病能力。
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