主要病害有：1.根腐病是以半知菌亚门核菌侵染引起的病害。病菌主要由土壤、病残株和种子带病传染。病菌侵染根茎部，使其变为褐色或黑色，导致植株枯萎死亡。防治方法：使用健康种子，与禾本科植物倒茬轮作，加强田间管理，深翻土地，田间病株；用75%百菌清可湿性粉剂600倍液或50%多菌灵可湿性粉剂600倍液喷洒。2.病毒病主要表现为花叶、斑驳、皱缩等,病毒在种子内越冬，播种带毒的种子后，幼苗即可发病，形成初侵染，然后通过蚜虫等传播，在田间形成系统性再侵染。防治方法：选用无病种子和抗病品种；防治传毒昆虫。
虫害种类很多，主要有：1.蛴螬，在土壤中生活，破坏植物根系，使幼苗枯萎死亡，造成缺苗，影响产量。2.小地老虎,俗称地蚕、切根虫。食性很杂，夜间出来危害幼茎。防治方法：用50％辛硫磷在播种前拌种，待种子吸干药液后即可播种；也可用50％辛硫磷按1：10比例拌细砂土，播前均匀撒入土中。3.蚜虫，主要危害绿豆的嫩茎、幼芽、顶端心叶和嫩叶叶背、花器及嫩荚等处吸取汁液，绿豆受害后,叶片卷缩，植株矮小，影响开花结实。防治方法：用40％乐果乳剂1000倍或氧化乐果2000倍液喷洒即可。4.绿豆象，成虫产卵于豆荚或豆粒上，幼虫钻入并蛀食豆粒，在豆粒内越冬，是危害严重的仓库害虫。防治方法：在20-25℃的温度下，用1.6克∕米3左右的磷化铝熏蒸3-5天,防治效果，既能杀虫又能杀卵，熏蒸过的绿豆仍可食用或作种子用。
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